Science.News
1.7.2024
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Jul 1, 2024
Tausende CRISPR-Systeme mit neuem Suchalgorithmus entdeckt
Mikrobielle Datenbanken sind mittlerweile so groß, dass eine effiziente Suche nach interessanten Enzymen schwierig geworden ist. Jetzt haben Wissenschaftler einen Suchalgorithmus entwickelt, der 188 Arten neuer, seltener CRISPR-Systeme in bakteriellen Genomen identifiziert hat, die Tausende von Einzelsystemen umfassen. Das Werkzeug, das aus dem Labor des CRISPR-Pioniers Feng Zhang stammt, nutzt Big-Data-Clustering-Ansätze, um riesige Mengen von Genomdaten schnell zu durchsuchen.
Quelle
Altae-Tran, H., Kannan, S., Suberski, A. J., Mears, K. S., Demircioglu, F. E., Möller, L., Kocalar, S., Oshiro, R., Makarova, K. S., Macrae, R. K., Koonin, E. V. & Zhang, F. (2023). Uncovering the functional diversity of rare CRISPR-CAS systems with deep terascale clustering. Science, 382(6673). https://doi.org/10.1126/science.adi1910